1.采用活性炭，通过物理方法将有机分子吸附到活性炭的孔隙中。该方法是一种安全性能高的有机物去除方法和使用方法。但不适合直径大于或类似活性炭的有机物，仍是经济效益差的资源。2.利用反渗透去除有机物去除率高，尤其是分子量大于200的有机物去除率可达90%以上。这种方法和活性炭吸附法多用于溶解有机物。
3.采用强氧化法，可用次氯酸钠等强氧化剂氧化分解有机物。
4.强化混凝法可以提高水中有机物的去除率。但是混凝剂的选择会影响有机物的去除率。一般来说，无机混凝剂的强化混凝效果较好。此外，混凝剂投加量过小，混凝效果不理想，但投加量过多会导致胶体再稳定，水的pH值也是影响强化混凝的主要因素。这种方法主要用于去除悬浮或胶体有机物。
5.采用生化法，目前广泛用于去除有机物。